《黃帝內經》資料庫內的書目由金仕起先生整理。

1. 傳統時期中國《黃帝內經》研究論著書目參考下列書籍彙編而成：多紀元胤，《中國醫籍考》，收入《皇漢醫學叢書》第三、四冊(上海：上海中醫學院出版社1993)；丁福保，《中國歷代醫藥書目》(台北：南天書局，1979)；黑田源次，《中國醫學書目》(台北：文海出版社，1930刊本)；岡西為人編，《續中國醫學書目》(台北：文海出版社，1971)；《宋以前醫籍考》(台北：古亭書屋，1969)，冊一，《醫經》；中華人民共和國衛生部中醫研究院、北京圖書館編，《中醫圖書聯合目錄》(北京：北京圖書館，1961)；嚴世芸主編，《中國醫籍通考》(上海：上海中醫學院出版社，1990)；郭靄春等編，《黃帝內經詞典》(天津：天津科學技術出版社，1991)；李茂如等編，《歷代史志書目著錄醫籍匯考》(北京：人民衛生出版社，1994)；馬繼興等，《日本現存中國散逸古醫籍》(北京：中國中醫研究院醫史文獻研究所，1997)；王洪圖主編，《黃帝內經研究大成》(北京：北京出版社，1997)，第七編，〈《黃帝內經》研究文獻匯編〉，第一部分，「中國歷代研究《黃帝內經》的圖書目錄匯編」，一、中華民國(1911年)以前研究《黃帝內經》的圖書目錄匯編，頁2609-2647。

2. 傳統時期中國《黃帝內經》研究論著書目括號內之數字，係以表示其書行世早晚之次第。該次第，則主要參考上註所引《《黃帝內經》研究大成》一書圖書目錄之編次。

3. 當代《黃帝內經》研究論著書目參考下列書籍彙編而成：嚴世芸主編，《中國醫籍通考》(上海：上海中醫學院出版社，1990)；郭靄春等編，《黃帝內經詞典》(天津：天津科學技術出版社，1991)；李茂如等編，《歷代史志書目著錄醫籍匯考》(北京：人民衛生出版社，1994)；馬繼興等，《日本現存中國散逸古醫籍》(北京：中國中醫研究院醫史文獻研究所，1997)；王洪圖主編，《黃帝內經研究大成》(北京：北京出版社，1997)，第七編，〈《黃帝內經》研究文獻匯編〉，第一部分，「中國歷代研究《黃帝內經》的圖書目錄匯編」，一、中華民國(1911年)以前研究《黃帝內經》的圖書目錄匯編，頁2609-2647。

4. 傳統時期日本的《黃帝內經》研究論著書目之編集參考以下資料：中央研究院歷史語言研究所傅斯年圖書館館藏微卷書目；王洪圖主編，《黃帝內經研究大成》(北京：北京出版社，1997)，第七編，〈《黃帝內經》研究文獻匯編〉，第二部分，「日本國歷代研究《黃帝內經》的圖書目錄匯編」，一、1950年以前日本國研究《黃帝內經》的圖書目錄，頁2663-2664；オリエント臨床文獻研究所監修，《《黃帝內經》稀書集成》(大阪：オリエント出版社，1996)，第一冊，〈《黃帝內經》稀書集成解題一、二、三〉，頁3-36；オリエント臨床文獻研究所監修，《臨床漢方診斷學叢書》(大阪：オリエント出版社，1996)，第十九冊，〈解說〉，頁16。